治方式使得华人与爪哇国原住民长期处于被隔绝甚至受挑拨的状态，为日后的排华埋下隐患 。
第二，华人迁居爪哇国之初就是为了经商贸易，经济实力明显优于当地人。
当地人生活日渐贫困仇富心态下，排华情绪一触即发。
因此爪哇国当局一有机会，甚至制造事端掀起排华事件挑拨当地人排华，已经成为爪哇国当局转移国内矛盾的一种惯用手段 。
在法制上，爪哇国政府对华人设立了一些歧视性的法律法规。
1945年的爪哇国宪法就明确规定，爪哇国总统必须由原住民担任，这具有浓重的种族歧视意味。
1967年爪哇国政府相继颁布了一些专门针对爪哇国华人的法律法规，比如禁止华裔使用华语，限制华裔宗教和文化习俗、更改华裔的族群称呼等等，总共有14项之多。
但是其中影响最为深远的几条是:禁止使用华语并禁止出版华语报纸书刊，禁止华人成立公开的社会政治团体。这直接导致华人参与爪哇国政治生活的道路被堵死一旦发生社会动荡，政治上无权的华人便遭遇灭顶之灾。